Regionalna Dyrekcja Ochrony Środowiska w Krakowie jest instytucją, która odpowiada za realizację polityki ochrony środowiska w województwie małopolskim w zakresie:

• ochrony przyrody, w tym m. in. obszarów Natura 2000 i rezerwatów przyrody;
• kontroli procesu inwestycyjnego poprzez m. in. przeprowadzanie ocen oddziaływania na środowisko przedsięwzięć oraz udział w strategicznych ocenach oddziaływania na środowisko;
• zapobiegania i naprawy szkód w środowisku.

Regionalna Dyrekcja Ochrony Środowiska w Krakowie odpowiada także za zarządzanie informacją o środowisku przyrodniczym i wykonuje zadania związane z udziałem różnych organizacji w systemie ekozarządzania i audytu (EMAS).

Regionalna Dyrekcja Ochrony Środowiska w Krakowie powstała na mocy ustawy z dnia 3 października 2008 r. o udostępnianiu informacji o środowisku i jego ochronie, udziale społeczeństwa w ochronie środowiska oraz o ocenach oddziaływania na środowisko.

Pracą RDOŚ w Krakowie kieruje Regionalny Dyrektor Ochrony Środowiska w Krakowie, którym od 1 września 2012 r. jest Rafał Rostecki.

Funkcję organu wyższego stopnia w stosunku do decyzji wydawanych przez Regionalnego Dyrektora Ochrony Środowiska w Krakowie pełni Generalny Dyrektor Ochrony Środowiska.

Podstawowe zadania Regionalnej Dyrekcji Ochrony Środowiska w Krakowie:

I. Współudział w realizacji polityki ochrony środowiska w zakresie ochrony przyrody i kontroli procesu inwestycyjnego, w tym:

• udział w strategicznych ocenach oddziaływania na środowisko,
• opiniowanie projektów studiów uwarunkowań i kierunków zagospodarowania przestrzennego gmin oraz miejscowych planów zagospodarowania przestrzennego i zmian do przyjętych dokumentów,
• przeprowadzanie ocen oddziaływania na środowisko przedsięwzięć mogących znacząco oddziaływać na środowisko lub udział w tych ocenach.

II. Wykonywanie zadań związanych z:

• ochrona i zarządzanie obszarami Natura 2000, rezerwatami przyrody i innymi formami ochrony przyrody na obszarze województwa – koordynacja funkcjonowania obszarów Natura 2000, opracowywanie planów zadań ochronnych dla obszarów Natura 2000, planów ochrony dla obszarów Natura 2000 i rezerwatów przyrody,
• wydawanie zezwoleń na odstępstwa od zakazów obowiązujących na terenie rezerwatów przyrody oraz na odstępstwa od zakazów obowiązujących w stosunku do dziko występujących roślin, grzybów i zwierząt objętych ochroną gatunkową,
• uzgadnianie projektów studiów uwarunkowań i kierunków zagospodarowania przestrzennego gmin oraz miejscowych planów zagospodarowania przestrzennego w części dotyczącej obszaru Natura 2000, rezerwatu przyrody i jego otuliny, parku krajobrazowego i jego otuliny, obszaru chronionego krajobrazu,
• uzgadnianie decyzji o ustaleniu lokalizacji inwestycji celu publicznego oraz decyzji o warunkach zabudowy w odniesieniu do ww. obszarów,
• prowadzenie rejestru form ochrony przyrody: rezerwatów przyrody, parków krajobrazowych, obszarów chronionego krajobrazu, pomników przyrody, stanowisk dokumentacyjnych, użytków ekologicznych i zespołów przyrodniczo -krajobrazowych.

III. Wydawanie zezwoleń, w tym m.in.:

• o odstępstwach od zakazów na terenie parków narodowych oraz rezerwatów przyrody,
• dotyczących hodowli i rozmnażania zwierząt i roślin, zezwoleń na wywóz za granicę meteorytów i kopalnych szczątków roślin i zwierząt, pozyskiwania gatunków objętych ochroną gatunkową i innych,
• na utworzenie i prowadzenie ogrodu botanicznego lub zoologicznego, a także ośrodka rehabilitacji zwierząt.

IV. Wykonywanie zadań określonych w ustawie o zapobieganiu szkodom w środowisku i ich naprawie

• zobowiązywanie podmiotów do przeprowadzenia działań zapobiegawczych i naprawczych w razie wystąpienia bezpośredniego zagrożenia szkodą w środowisku lub szkody w środowisku,
• uzgadnianie warunków prowadzenia działań naprawczych,
• podejmowanie działań zapobiegawczych lub naprawczych.

Statut Regionalnej Dyrekcji Ochrony Środowiska w Krakowie